Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo1Q9CXH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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