Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9CWU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CWU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CWU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CWU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CWU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CWU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CWU4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms