Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fcf1Q9CTH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcf1Q9CTH6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms