Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrxn1Q9CS84 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrxn1Q9CS84 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms