Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpda2Q9CRC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gnpda2Q9CRC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms