Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5sQ9CRA7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5sQ9CRA7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms