Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg12Q9CQY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg12Q9CQY1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms