Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rer1Q9CQU3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rer1Q9CQU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rer1Q9CQU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rer1Q9CQU3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rer1Q9CQU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rer1Q9CQU3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms