Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rwdd1Q9CQK7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rwdd1Q9CQK7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms