Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd2aQ9CQJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms