Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl11Q9CQF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl11Q9CQF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrpl11Q9CQF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms