Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC8

Spg21, Maspardin, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg21Q9CQC8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg21Q9CQC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg21Q9CQC8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg21Q9CQC8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms