Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Ubl4bQ9CQ84 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ubl4bQ9CQ84 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ubl4bQ9CQ84 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms