Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700129C05RikQ9CQ77 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700129C05RikQ9CQ77 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms