Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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2010109I03RikQ9CQ11 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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2010109I03RikQ9CQ11 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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2010109I03RikQ9CQ11 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2010109I03RikQ9CQ11 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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2010109I03RikQ9CQ11 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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2010109I03RikQ9CQ11 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2010109I03RikQ9CQ11 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2010109I03RikQ9CQ11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2010109I03RikQ9CQ11 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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