Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg3Q9CPX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg3Q9CPX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atg3Q9CPX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms