Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930550L24RikQ99PA7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms