Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NsmfQ99NF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NsmfQ99NF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NsmfQ99NF2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms