Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brms1Q99N20 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brms1Q99N20 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brms1Q99N20 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms