Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mccc1Q99MR8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc1Q99MR8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc1Q99MR8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms