Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col25a1Q99MQ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col25a1Q99MQ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms