Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PccbQ99MN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PccbQ99MN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms