Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME2

Wdr6, WD repeat-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr6Q99ME2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr6Q99ME2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr6Q99ME2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms