Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr3Q99MB1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr3Q99MB1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms