Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clp1Q99LI9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clp1Q99LI9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms