Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99KU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99KU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99KU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99KU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99KU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q99KU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q99KU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q99KU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q99KU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q99KU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q99KU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q99KU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q99KU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q99KU6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q99KU6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q99KU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q99KU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q99KU6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q99KU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Q99KU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q99KU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q99KU6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q99KU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q99KU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q99KU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q99KU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q99KU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q99KU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q99KU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms