Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DhddsQ99KU1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DhddsQ99KU1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DhddsQ99KU1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DhddsQ99KU1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DhddsQ99KU1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DhddsQ99KU1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DhddsQ99KU1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms