Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmp1Q99KU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmp1Q99KU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms