Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf19Q99KP6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms