Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps4Q99KG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps4Q99KG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms