Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dok4Q99KE3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms