Protein–RNA interactions for Protein: Q99J93

Ifitm2, Interferon-induced transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm2Q99J93 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifitm2Q99J93 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm2Q99J93 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm2Q99J93 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms