Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfdQ925I7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdgfdQ925I7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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