Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trps1Q925H1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trps1Q925H1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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