Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4ip1Q924D0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtn4ip1Q924D0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms