Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NelfcdQ922L6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfcdQ922L6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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