Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx4Q91YJ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx4Q91YJ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Snx4Q91YJ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx4Q91YJ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx4Q91YJ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx4Q91YJ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx4Q91YJ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx4Q91YJ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx4Q91YJ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms