Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg13Q91YI1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg13Q91YI1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg13Q91YI1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg13Q91YI1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms