Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha2Q91Y17 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha2Q91Y17 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha2Q91Y17 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms