Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps36Q91XD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms