Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trex1Q91XB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trex1Q91XB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms