Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps3Q91VB4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps3Q91VB4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms