Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhdc3Q8VEM9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms