Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc71Q8VEG0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc71Q8VEG0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc71Q8VEG0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc71Q8VEG0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc71Q8VEG0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc71Q8VEG0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms