Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx7Q8VDS3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cbx7Q8VDS3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms