Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fyco1Q8VDC1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fyco1Q8VDC1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fyco1Q8VDC1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.1 ms