Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBY2

Camkk1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk1Q8VBY2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Camkk1Q8VBY2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms