Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snap47Q8R570 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snap47Q8R570 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snap47Q8R570 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms