Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Top1mtQ8R4U6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top1mtQ8R4U6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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