Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c5Q8R2T8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c5Q8R2T8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c5Q8R2T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms